Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cfap53Q9D439 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfap53Q9D439 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfap53Q9D439 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfap53Q9D439 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfap53Q9D439 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfap53Q9D439 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfap53Q9D439 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfap53Q9D439 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfap53Q9D439 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfap53Q9D439 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfap53Q9D439 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfap53Q9D439 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cfap53Q9D439 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cfap53Q9D439 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cfap53Q9D439 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cfap53Q9D439 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cfap53Q9D439 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfap53Q9D439 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cfap53Q9D439 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms