Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pus10Q9D3U0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pus10Q9D3U0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pus10Q9D3U0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pus10Q9D3U0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pus10Q9D3U0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pus10Q9D3U0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pus10Q9D3U0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pus10Q9D3U0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pus10Q9D3U0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pus10Q9D3U0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pus10Q9D3U0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pus10Q9D3U0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pus10Q9D3U0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pus10Q9D3U0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pus10Q9D3U0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pus10Q9D3U0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pus10Q9D3U0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pus10Q9D3U0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pus10Q9D3U0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pus10Q9D3U0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pus10Q9D3U0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pus10Q9D3U0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pus10Q9D3U0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms