Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trmt44Q9D2Q2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Trmt44Q9D2Q2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trmt44Q9D2Q2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trmt44Q9D2Q2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trmt44Q9D2Q2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trmt44Q9D2Q2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trmt44Q9D2Q2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trmt44Q9D2Q2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trmt44Q9D2Q2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trmt44Q9D2Q2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Trmt44Q9D2Q2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trmt44Q9D2Q2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trmt44Q9D2Q2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trmt44Q9D2Q2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trmt44Q9D2Q2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trmt44Q9D2Q2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trmt44Q9D2Q2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trmt44Q9D2Q2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Trmt44Q9D2Q2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trmt44Q9D2Q2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trmt44Q9D2Q2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trmt44Q9D2Q2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trmt44Q9D2Q2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trmt44Q9D2Q2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trmt44Q9D2Q2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trmt44Q9D2Q2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trmt44Q9D2Q2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trmt44Q9D2Q2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trmt44Q9D2Q2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trmt44Q9D2Q2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trmt44Q9D2Q2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trmt44Q9D2Q2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trmt44Q9D2Q2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.3 ms