Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krtap5-3Q9D226 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krtap5-3Q9D226 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krtap5-3Q9D226 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Krtap5-3Q9D226 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krtap5-3Q9D226 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krtap5-3Q9D226 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krtap5-3Q9D226 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krtap5-3Q9D226 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krtap5-3Q9D226 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krtap5-3Q9D226 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krtap5-3Q9D226 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krtap5-3Q9D226 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krtap5-3Q9D226 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krtap5-3Q9D226 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krtap5-3Q9D226 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krtap5-3Q9D226 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krtap5-3Q9D226 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Krtap5-3Q9D226 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krtap5-3Q9D226 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krtap5-3Q9D226 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krtap5-3Q9D226 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Krtap5-3Q9D226 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krtap5-3Q9D226 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krtap5-3Q9D226 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krtap5-3Q9D226 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krtap5-3Q9D226 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Krtap5-3Q9D226 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krtap5-3Q9D226 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krtap5-3Q9D226 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krtap5-3Q9D226 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krtap5-3Q9D226 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krtap5-3Q9D226 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krtap5-3Q9D226 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krtap5-3Q9D226 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krtap5-3Q9D226 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krtap5-3Q9D226 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krtap5-3Q9D226 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krtap5-3Q9D226 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krtap5-3Q9D226 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krtap5-3Q9D226 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms