Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D1K7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9D1K7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9D1K7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9D1K7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9D1K7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9D1K7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D1K7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D1K7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms