Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan11Q9D1D1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan11Q9D1D1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan11Q9D1D1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan11Q9D1D1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan11Q9D1D1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan11Q9D1D1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan11Q9D1D1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan11Q9D1D1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan11Q9D1D1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan11Q9D1D1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan11Q9D1D1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan11Q9D1D1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan11Q9D1D1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan11Q9D1D1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan11Q9D1D1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan11Q9D1D1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan11Q9D1D1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan11Q9D1D1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan11Q9D1D1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tspan11Q9D1D1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms