Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdhd3Q9CYW4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdhd3Q9CYW4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms