Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmed5Q9CXE7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed5Q9CXE7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms