Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sft2d3Q9CSV6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sft2d3Q9CSV6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sft2d3Q9CSV6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sft2d3Q9CSV6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sft2d3Q9CSV6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sft2d3Q9CSV6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sft2d3Q9CSV6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sft2d3Q9CSV6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sft2d3Q9CSV6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sft2d3Q9CSV6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sft2d3Q9CSV6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sft2d3Q9CSV6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sft2d3Q9CSV6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sft2d3Q9CSV6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sft2d3Q9CSV6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sft2d3Q9CSV6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sft2d3Q9CSV6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sft2d3Q9CSV6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms