Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gadd45gip1Q9CR59 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gadd45gip1Q9CR59 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gadd45gip1Q9CR59 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms