Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg12Q9CQY1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg12Q9CQY1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms