Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifitm3Q9CQW9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ifitm3Q9CQW9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ifitm3Q9CQW9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ifitm3Q9CQW9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms