Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim8Q9CQQ0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms