Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc2Q9CQP2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc2Q9CQP2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms