Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nicn1Q9CQM0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms