Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTRAFQ9CQE8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RTRAFQ9CQE8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTRAFQ9CQE8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.8 ms