Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nipsnap3bQ9CQE1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms