Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CQC3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9CQC3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9CQC3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9CQC3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9CQC3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CQC3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CQC3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CQC3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CQC3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9CQC3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9CQC3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9CQC3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CQC3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CQC3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CQC3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CQC3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CQC3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CQC3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CQC3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CQC3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CQC3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CQC3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CQC3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CQC3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CQC3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CQC3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CQC3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CQC3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms