Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA3

Sdhb, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhbQ9CQA3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SdhbQ9CQA3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SdhbQ9CQA3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SdhbQ9CQA3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SdhbQ9CQA3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SdhbQ9CQA3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SdhbQ9CQA3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SdhbQ9CQA3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SdhbQ9CQA3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SdhbQ9CQA3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SdhbQ9CQA3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SdhbQ9CQA3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SdhbQ9CQA3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SdhbQ9CQA3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SdhbQ9CQA3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SdhbQ9CQA3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SdhbQ9CQA3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SdhbQ9CQA3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SdhbQ9CQA3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SdhbQ9CQA3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SdhbQ9CQA3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SdhbQ9CQA3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SdhbQ9CQA3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SdhbQ9CQA3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SdhbQ9CQA3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms