Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA0

Cenpm, Centromere protein M, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpmQ9CQA0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CenpmQ9CQA0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CenpmQ9CQA0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CenpmQ9CQA0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CenpmQ9CQA0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CenpmQ9CQA0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CenpmQ9CQA0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CenpmQ9CQA0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CenpmQ9CQA0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpmQ9CQA0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CenpmQ9CQA0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CenpmQ9CQA0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.9 ms