Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkp2Q9CQ73 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkp2Q9CQ73 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkp2Q9CQ73 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkp2Q9CQ73 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkp2Q9CQ73 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkp2Q9CQ73 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkp2Q9CQ73 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkp2Q9CQ73 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkp2Q9CQ73 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkp2Q9CQ73 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkp2Q9CQ73 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkp2Q9CQ73 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkp2Q9CQ73 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkp2Q9CQ73 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkp2Q9CQ73 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pkp2Q9CQ73 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkp2Q9CQ73 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkp2Q9CQ73 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkp2Q9CQ73 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkp2Q9CQ73 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkp2Q9CQ73 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkp2Q9CQ73 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkp2Q9CQ73 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkp2Q9CQ73 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkp2Q9CQ73 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkp2Q9CQ73 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkp2Q9CQ73 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms