Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pole4Q9CQ36 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pole4Q9CQ36 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pole4Q9CQ36 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pole4Q9CQ36 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pole4Q9CQ36 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pole4Q9CQ36 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pole4Q9CQ36 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pole4Q9CQ36 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pole4Q9CQ36 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pole4Q9CQ36 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pole4Q9CQ36 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pole4Q9CQ36 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pole4Q9CQ36 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pole4Q9CQ36 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pole4Q9CQ36 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pole4Q9CQ36 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pole4Q9CQ36 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pole4Q9CQ36 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pole4Q9CQ36 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pole4Q9CQ36 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pole4Q9CQ36 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pole4Q9CQ36 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pole4Q9CQ36 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pole4Q9CQ36 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pole4Q9CQ36 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pole4Q9CQ36 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pole4Q9CQ36 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pole4Q9CQ36 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pole4Q9CQ36 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pole4Q9CQ36 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pole4Q9CQ36 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms