Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc18Q9CQ07 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc18Q9CQ07 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc18Q9CQ07 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms