Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW4

Arpc5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5Q9CPW4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arpc5Q9CPW4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arpc5Q9CPW4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arpc5Q9CPW4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arpc5Q9CPW4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arpc5Q9CPW4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arpc5Q9CPW4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arpc5Q9CPW4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms