Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nsmce3Q9CPR8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nsmce3Q9CPR8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nsmce3Q9CPR8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms