Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ino80bQ99PT3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ino80bQ99PT3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ino80bQ99PT3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms