Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rrbp1Q99PL5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rrbp1Q99PL5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rrbp1Q99PL5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rrbp1Q99PL5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rrbp1Q99PL5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Rrbp1Q99PL5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rrbp1Q99PL5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rrbp1Q99PL5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rrbp1Q99PL5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rrbp1Q99PL5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rrbp1Q99PL5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rrbp1Q99PL5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Rrbp1Q99PL5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rrbp1Q99PL5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rrbp1Q99PL5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Rrbp1Q99PL5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rrbp1Q99PL5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rrbp1Q99PL5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rrbp1Q99PL5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Rrbp1Q99PL5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Rrbp1Q99PL5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rrbp1Q99PL5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Rrbp1Q99PL5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rrbp1Q99PL5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rrbp1Q99PL5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rrbp1Q99PL5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rrbp1Q99PL5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rrbp1Q99PL5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rrbp1Q99PL5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rrbp1Q99PL5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rrbp1Q99PL5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rrbp1Q99PL5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rrbp1Q99PL5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rrbp1Q99PL5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rrbp1Q99PL5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Rrbp1Q99PL5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rrbp1Q99PL5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rrbp1Q99PL5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rrbp1Q99PL5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rrbp1Q99PL5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Rrbp1Q99PL5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rrbp1Q99PL5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rrbp1Q99PL5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rrbp1Q99PL5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rrbp1Q99PL5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rrbp1Q99PL5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rrbp1Q99PL5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rrbp1Q99PL5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rrbp1Q99PL5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rrbp1Q99PL5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rrbp1Q99PL5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Rrbp1Q99PL5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rrbp1Q99PL5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rrbp1Q99PL5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rrbp1Q99PL5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rrbp1Q99PL5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rrbp1Q99PL5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rrbp1Q99PL5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rrbp1Q99PL5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rrbp1Q99PL5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Rrbp1Q99PL5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rrbp1Q99PL5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Rrbp1Q99PL5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rrbp1Q99PL5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rrbp1Q99PL5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rrbp1Q99PL5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rrbp1Q99PL5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rrbp1Q99PL5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rrbp1Q99PL5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rrbp1Q99PL5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rrbp1Q99PL5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rrbp1Q99PL5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rrbp1Q99PL5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rrbp1Q99PL5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rrbp1Q99PL5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Rrbp1Q99PL5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Rrbp1Q99PL5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rrbp1Q99PL5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Rrbp1Q99PL5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rrbp1Q99PL5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rrbp1Q99PL5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rrbp1Q99PL5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rrbp1Q99PL5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rrbp1Q99PL5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Rrbp1Q99PL5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rrbp1Q99PL5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rrbp1Q99PL5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rrbp1Q99PL5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rrbp1Q99PL5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rrbp1Q99PL5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Rrbp1Q99PL5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rrbp1Q99PL5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rrbp1Q99PL5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Rrbp1Q99PL5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rrbp1Q99PL5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rrbp1Q99PL5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms