Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab27bQ99P58 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab27bQ99P58 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms