Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Rnf17Q99MV7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Rnf17Q99MV7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Rnf17Q99MV7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Rnf17Q99MV7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rnf17Q99MV7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rnf17Q99MV7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Rnf17Q99MV7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rnf17Q99MV7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rnf17Q99MV7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rnf17Q99MV7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rnf17Q99MV7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rnf17Q99MV7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rnf17Q99MV7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rnf17Q99MV7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rnf17Q99MV7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rnf17Q99MV7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Rnf17Q99MV7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rnf17Q99MV7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rnf17Q99MV7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rnf17Q99MV7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rnf17Q99MV7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rnf17Q99MV7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rnf17Q99MV7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rnf17Q99MV7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rnf17Q99MV7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rnf17Q99MV7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rnf17Q99MV7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rnf17Q99MV7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rnf17Q99MV7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rnf17Q99MV7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Rnf17Q99MV7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rnf17Q99MV7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rnf17Q99MV7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rnf17Q99MV7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rnf17Q99MV7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rnf17Q99MV7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Rnf17Q99MV7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rnf17Q99MV7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rnf17Q99MV7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rnf17Q99MV7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rnf17Q99MV7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rnf17Q99MV7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Rnf17Q99MV7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rnf17Q99MV7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Rnf17Q99MV7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Rnf17Q99MV7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rnf17Q99MV7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Rnf17Q99MV7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rnf17Q99MV7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Rnf17Q99MV7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Rnf17Q99MV7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Rnf17Q99MV7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Rnf17Q99MV7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rnf17Q99MV7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rnf17Q99MV7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rnf17Q99MV7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rnf17Q99MV7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rnf17Q99MV7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rnf17Q99MV7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rnf17Q99MV7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Rnf17Q99MV7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rnf17Q99MV7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rnf17Q99MV7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rnf17Q99MV7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rnf17Q99MV7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rnf17Q99MV7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rnf17Q99MV7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rnf17Q99MV7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Rnf17Q99MV7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rnf17Q99MV7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rnf17Q99MV7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rnf17Q99MV7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rnf17Q99MV7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rnf17Q99MV7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rnf17Q99MV7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rnf17Q99MV7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rnf17Q99MV7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rnf17Q99MV7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Rnf17Q99MV7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rnf17Q99MV7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rnf17Q99MV7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rnf17Q99MV7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rnf17Q99MV7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rnf17Q99MV7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Rnf17Q99MV7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rnf17Q99MV7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rnf17Q99MV7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rnf17Q99MV7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rnf17Q99MV7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rnf17Q99MV7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rnf17Q99MV7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rnf17Q99MV7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Rnf17Q99MV7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rnf17Q99MV7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rnf17Q99MV7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rnf17Q99MV7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms