Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tdrd1Q99MV1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tdrd1Q99MV1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tdrd1Q99MV1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tdrd1Q99MV1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tdrd1Q99MV1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tdrd1Q99MV1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tdrd1Q99MV1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tdrd1Q99MV1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Tdrd1Q99MV1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tdrd1Q99MV1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tdrd1Q99MV1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tdrd1Q99MV1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tdrd1Q99MV1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tdrd1Q99MV1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tdrd1Q99MV1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tdrd1Q99MV1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tdrd1Q99MV1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tdrd1Q99MV1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tdrd1Q99MV1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tdrd1Q99MV1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tdrd1Q99MV1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd1Q99MV1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tdrd1Q99MV1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms