Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SncaipQ99ME3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SncaipQ99ME3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SncaipQ99ME3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.1 ms