Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm2d1Q99MB3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tm2d1Q99MB3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tm2d1Q99MB3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms