Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Tlr3Q99MB1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr3Q99MB1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms