Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gins4Q99LZ3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gins4Q99LZ3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms