Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM3

Smtnl1, Smoothelin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtnl1Q99LM3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smtnl1Q99LM3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smtnl1Q99LM3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms