Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk5rap3Q99LM2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms