Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnpo2Q99LG2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnpo2Q99LG2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnpo2Q99LG2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnpo2Q99LG2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnpo2Q99LG2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnpo2Q99LG2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnpo2Q99LG2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnpo2Q99LG2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnpo2Q99LG2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnpo2Q99LG2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnpo2Q99LG2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnpo2Q99LG2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnpo2Q99LG2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnpo2Q99LG2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnpo2Q99LG2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnpo2Q99LG2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnpo2Q99LG2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnpo2Q99LG2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnpo2Q99LG2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnpo2Q99LG2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnpo2Q99LG2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnpo2Q99LG2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnpo2Q99LG2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnpo2Q99LG2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnpo2Q99LG2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnpo2Q99LG2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms