Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SardhQ99LB7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SardhQ99LB7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SardhQ99LB7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SardhQ99LB7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SardhQ99LB7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SardhQ99LB7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SardhQ99LB7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SardhQ99LB7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SardhQ99LB7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SardhQ99LB7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SardhQ99LB7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SardhQ99LB7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SardhQ99LB7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SardhQ99LB7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SardhQ99LB7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SardhQ99LB7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SardhQ99LB7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SardhQ99LB7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms