Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TriobpQ99KW3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TriobpQ99KW3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TriobpQ99KW3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms