Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Reep3Q99KK1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Reep3Q99KK1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Reep3Q99KK1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms