Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlcd1Q99JT6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlcd1Q99JT6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlcd1Q99JT6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tlcd1Q99JT6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tlcd1Q99JT6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlcd1Q99JT6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tlcd1Q99JT6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlcd1Q99JT6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlcd1Q99JT6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlcd1Q99JT6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlcd1Q99JT6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlcd1Q99JT6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlcd1Q99JT6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlcd1Q99JT6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlcd1Q99JT6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlcd1Q99JT6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlcd1Q99JT6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms