Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Krcc1Q99JT5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krcc1Q99JT5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms