Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim7Q923T7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim7Q923T7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim7Q923T7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms