Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NelfcdQ922L6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NelfcdQ922L6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NelfcdQ922L6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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