Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Clip1Q922J3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Clip1Q922J3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Clip1Q922J3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Clip1Q922J3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Clip1Q922J3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Clip1Q922J3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Clip1Q922J3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Clip1Q922J3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Clip1Q922J3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Clip1Q922J3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Clip1Q922J3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Clip1Q922J3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Clip1Q922J3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Clip1Q922J3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Clip1Q922J3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Clip1Q922J3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Clip1Q922J3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Clip1Q922J3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Clip1Q922J3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Clip1Q922J3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Clip1Q922J3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Clip1Q922J3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Clip1Q922J3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Clip1Q922J3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Clip1Q922J3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Clip1Q922J3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Clip1Q922J3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Clip1Q922J3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Clip1Q922J3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Clip1Q922J3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Clip1Q922J3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Clip1Q922J3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Clip1Q922J3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Clip1Q922J3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Clip1Q922J3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Clip1Q922J3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Clip1Q922J3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Clip1Q922J3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Clip1Q922J3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Clip1Q922J3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Clip1Q922J3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Clip1Q922J3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Clip1Q922J3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Clip1Q922J3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Clip1Q922J3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms