Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tubb6Q922F4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tubb6Q922F4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubb6Q922F4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms