Protein–RNA interactions for Protein: Q921K8

Tcaf2, TRPM8 channel-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf2Q921K8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcaf2Q921K8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcaf2Q921K8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms