Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt16hQ920B9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt16hQ920B9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt16hQ920B9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt16hQ920B9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt16hQ920B9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt16hQ920B9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Supt16hQ920B9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Supt16hQ920B9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Supt16hQ920B9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Supt16hQ920B9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Supt16hQ920B9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Supt16hQ920B9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Supt16hQ920B9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Supt16hQ920B9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Supt16hQ920B9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Supt16hQ920B9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Supt16hQ920B9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Supt16hQ920B9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Supt16hQ920B9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Supt16hQ920B9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Supt16hQ920B9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Supt16hQ920B9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Supt16hQ920B9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Supt16hQ920B9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Supt16hQ920B9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Supt16hQ920B9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Supt16hQ920B9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Supt16hQ920B9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Supt16hQ920B9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Supt16hQ920B9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Supt16hQ920B9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Supt16hQ920B9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Supt16hQ920B9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Supt16hQ920B9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Supt16hQ920B9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt16hQ920B9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt16hQ920B9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt16hQ920B9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Supt16hQ920B9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Supt16hQ920B9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Supt16hQ920B9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Supt16hQ920B9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Supt16hQ920B9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Supt16hQ920B9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Supt16hQ920B9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms