Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc1Q91Z38 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc1Q91Z38 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc1Q91Z38 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc1Q91Z38 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc1Q91Z38 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc1Q91Z38 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc1Q91Z38 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc1Q91Z38 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc1Q91Z38 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc1Q91Z38 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc1Q91Z38 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms