Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg13Q91YI1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg13Q91YI1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg13Q91YI1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg13Q91YI1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg13Q91YI1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg13Q91YI1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg13Q91YI1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg13Q91YI1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg13Q91YI1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg13Q91YI1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg13Q91YI1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg13Q91YI1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg13Q91YI1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg13Q91YI1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg13Q91YI1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg13Q91YI1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg13Q91YI1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atg13Q91YI1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg13Q91YI1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg13Q91YI1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg13Q91YI1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg13Q91YI1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg13Q91YI1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg13Q91YI1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg13Q91YI1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg13Q91YI1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg13Q91YI1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg13Q91YI1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg13Q91YI1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg13Q91YI1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg13Q91YI1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg13Q91YI1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg13Q91YI1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg13Q91YI1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg13Q91YI1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg13Q91YI1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg13Q91YI1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg13Q91YI1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atg13Q91YI1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg13Q91YI1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atg13Q91YI1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg13Q91YI1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg13Q91YI1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg13Q91YI1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg13Q91YI1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg13Q91YI1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg13Q91YI1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg13Q91YI1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg13Q91YI1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg13Q91YI1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg13Q91YI1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg13Q91YI1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms